人工智能算法有助于快速分析蛋白質折疊結構
時間:2019-09-12 來源:科技部
近日,英國《自然》雜志報道,美國哈佛大學醫學院生物學家AlQuraishi開發出新型人工智能算法,能夠快速分析預測蛋白質三維結構,大大提高蛋白質三維結構預測的效率,將預測時間從若干小時或幾天縮短至幾毫秒。
報道稱,蛋白質三維結構與蛋白質功能密切相關,當前生物學界一大挑戰在于如何基于氨基酸序列預測蛋白質三維結構。目前常用的實驗室測定方法為X射線晶體衍射測定。隨著人工智能技術的發展,科學界不斷嘗試利用人工智能技術從蛋白質一級結構(即氨基酸序列),分析預測蛋白質的三級結構(即三維空間結構)。ogle人工智能子公司DeepMind曾開發出新型蛋白質三維結構預測算法AlphaFold,取得一定進展,有助于研究人員更好理解疾病分子機制和設計藥物。
該新型算法主要基于神經網絡算法,利用氨基酸序列和蛋白質結構對應的現有數據進行訓練,對未知序列能夠產生的結構進行預測。目前,此算法需要花費數月時間進行訓練,但完成訓練后幾乎能夠實現即時預測。