我國科學家研發出研究細胞間相互作用的原位捕獲新方法
在生命體內追蹤不同類型細胞間的相互作用,能夠增進對生命體發育過程的了解,揭示細胞功能,或者用于追蹤組織對外界刺激的響應。然而,現有研究細胞互作的方法大都需要預知相互作用的細胞類型,難以在復雜的活體環境下發現或研究未知的細胞間相互作用,因此急需研發一種新型標記方法用于標記自然狀態下的未知細胞類型的細胞,并研究它們之間的相互作用。
在國家重點研發計劃“蛋白質機器與生命過程調控”重點專項的支持下,北京大學陳鵬教授研究團隊借助“蛋白質定向進化”技術和“鄰近標記”策略,實現了細胞之間動態相互作用的原位捕獲。研究團隊將金黃色葡萄球菌的分選酶Sortase A(SrtA)定向進化得到的分選酶(mgSrtA)展示在待研究的細胞表面,mgSrtA可以借助臨近效應將含有生物素(biotin)標簽的分選肽biotin-LPETG與單一甘氨酸的N端氨基共價相連,由于任意細胞的表面蛋白中有大約5%含有N端單一甘氨酸,因此該方法能夠對與待研究細胞相互作用的任意細胞進行原位捕獲與鑒定。該新標記方法不僅易于監測,在未來還可以與多種下游分析平臺兼容,完成對相互作用細胞的捕獲、富集和測序,從而能夠獲得細胞間相互作用在時間、空間、類型等多方面的信息。該研究成果將蛋白質鄰近標記策略從“胞內”拓展至了“胞外”空間,在免疫應答、神經傳導等領域具有廣闊的應用前景。相關研究成果近期在《美國化學會志》雜志上發表。